动物尸体是实验动物设施产生的主要废弃物之一。动物房舍中必须设置容量充足的冷藏设备以暂时贮存尸体。感染病原微生物或放射性物质的动物尸体，可以直接做掩埋处理或焚烧，感染性的动物尸体应该用装载生物危害物质的塑胶袋妥善包装，经蒸汽高温高压灭菌后，再以一般处理无害性动物尸体方法如置入冷冻库冷冻保存，尸体由冷冻库取出后需先解冻再予焚烧以避免燃烧不完全及浪费燃料。